这两家公司发生的纠纷，主要是因为商标权的纠纷。其实这次的纠纷主要是双方的名字非常重合，一个叫北京无印良品，一个叫日本无印良品，所以说在名字高度重合的时候，那么就有了一个到底谁才是正宗的，所以就有了这场纠纷，最终在这第1场官司里面，由北京市高级人民法院进行宣判认为，日本无印良品在一些产品设计上面，有侵犯商标的情况，而且这个侵犯商标的情况主要是侵犯了北京棉田纺织品有限公司的商标权。这个判决发布之后，日本无印良品的公司表示会对这次判决中所涉及的产品进行整改。
第2场官司是涉及商业诋毁和不正当关系。首先这是由北京无印良品对日本无印良品提起的一起诉讼，北京无印良品公司他们认为日本的无印良品公司，它是在自己注册之前提早进行抢先注册，所以对自己的品牌名誉造成了损害，他们这种方法是存在不正当竞争的，所以要求对方赔偿300万元和10万元的律师费。这个案件是在北京市朝阳区人民法院的知识产权审判庭进行开庭审理的。
而当庭的法官他们认为日本无印良品是不是构成商业诋毁，主要还是要看日本方面，是否构成反不正当竞争法，如果构成的话，那么日本的无印良品公司将会败诉，而北京的将会申诉，截止到2021年的5月3日，这起商业诋毁不正当竞争案件，并没有宣判，还处于审理阶段。
其实日本无印良品在上个世纪80年代就已经诞生了，不过进入中国市场是在2005年的时候才进入的，所以按照中国的法律来说，它是否具有侵权的情况，那么还是有待相关的法律进行判决的，其实虽然说日本无印良品，它诞生的时间比中国的无印良品时间要早，但是在中国申请的时候，日本的无印良品公司并没有进入中国市场，北京的无印良品公司是受到法律保护的。就算日本无印良品公司在国际上有知名度，但是在进入中国市场之前，是不具备有中国法律的保护力度的。
两家工厂就商标词的抢注问题产生了纠纷，目前两者的官司没有得到明确解决，还需要进一步协商
因为日本无印良品发表的声明存在商业诋毁，对北京无印良品造成了不好的影响，所以提出了诉讼。
因为双方因为“无印良品”商标权产生了纠纷，之前两家公司就已经在法庭上面对峙过了，被告方的日本无印良品败诉，需要停止侵犯北京无印良品公司商标的专用权，而之后日本无印良品用了“抢注”两个字来形容这次事件，北京无印良品对此表示质疑，并且再次告上法庭，双方的冲突都是因为商标纠纷。
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